第88回選抜高等学校野球大会の日程、出場校数、地区別出場校数等は次のとおりです。
大会日程
平成28年3月20日（日）から12日間＜準々決勝翌日の休養日1日含む＞
会場
阪神甲子園球場
出場校選考委員会
平成28年1月29日（金）＜毎日新聞大阪本社オーバルホール＞
組み合わせ抽選会
平成28年3月11日（金）＜毎日新聞大阪本社オーバルホール＞
出場校数
32校
＜内訳＞
○一般選考（28校）
| 北海道 | 1 | 東北 | 2 |
| 関東（4）・東京（1） | 6 | 東海 | 2 |
| 北信越 | 2 | 近畿 | 6 |
| 中国（2）・四国（2） | 5 | 九州 | 4 |
※関東・東京、中国・四国の（）内は各地区出場校数で、残り1校は両地区を比較した上で振り当てます。
○21世紀枠（3校）
○明治神宮大会枠（1枠・四国地区）